一是性质不同。房屋网签备案是依据《城市房地产管理法》的规定、国务院的要求，房产管理部门实施的行政管理措施，属于行政管理制度。不动产登记是由《民法典》确定的物权登记制度。

二是功能不同。房屋网签备案不仅具有保护交易当事人的功能，还具有房屋管部门及时获取市场信息，加强市场监管，维护房地产市场秩序的功能。不动产登记具有公示物权归属的功能。

三是强制性不同。房屋网签备案是强制性制度，房地产开发企业等交易当事人只要签订了房屋交易合同就应当在法定时间内向房屋管部门备案。不动产登记需交易当事人自愿申请。属于双方共同申请的，例如预告登记，需双方共同申请。不动产登记机构不能强制要求当事人办理登记，不能规定当事人应当在合同网签备案后多少时间内办理登记，也不能对未申请登记的当事人进行处罚。

四是适用范围不同。房屋网签备案包括新建商品房买卖合同、存量房买卖合同、房屋抵押合同、房屋租赁合同。不动产登记机构办理的物权登记，不包括房屋租赁。